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至本医疗:靠独创的生物信息分析算法和大数据平台称雄基因检测领域

  苹果公司创始人史蒂夫·乔布斯是世界上最早尝试基因检测治疗癌症的人。2004年,当他发现自己被确诊患有胰腺癌后,曾花费10万美元,请哈佛大学几个教授帮助自己进行了基因检测,延续了8年的寿命,创造了癌症治疗的奇迹。

  2010年,在风险资本的帮助下,当年帮助乔布斯进行基因检测的那几位哈佛大学教授创办了基因检测创业公司Foundation Medicine(以下简称:FMI),比尔·盖茨、Google Venture都是它的股东。2013年,FMI成功在美国纳斯达克上市。FMI从创办之初到现在,一直在引领全球精准医疗的革命,直接影响了全球10几万患者的治疗,以及数十个创新药物的研发。

  基因检测技术发展到今天,不仅在治疗上有重大意义,在疾病预防上同样至关重要。2013年5月,奥斯卡影后安吉丽娜·朱莉发现自己有患乳腺癌的风险,她通过基因检测和相应的手术将患病风险从87%降到了5%。

  美国是基因检测技术最发达,商用化程度最高,以及政策最开放的国家,Illumina、FMI、LifeTechnologies和23andMe等公司是全球基因检测领域的领头羊。中国是在基因检测技术领域追赶美国的国家之一,一大批新创公司在近几年成立。至本医疗(上海)科技有限公司(以下简称:至本医疗)是目前中国领先的头部基因检测技术公司,它的创始人王凯在FMI成立之初就加入进去,后来成为其主要技术负责人之一,同时,他也是FMI负责企业文化制定的7人委员会成员。可以说,至本医疗是国内最具有FMI气质的基因检测公司。

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  图:至本医疗创始人王凯

  2015年,随着中国十三五规划中写入“精准医疗”等内容,基因检测在中国发展的政策大门被打开,王凯看到了机会,在家人的支持下,放弃了在美国的优渥工作和生活,返回中国创业,成立了至本医疗。他希望通过自己在海外多年学习、工作掌握到的先进基因检测技术,为中国的精准医疗事业贡献自己的力量。

  一直站在世界基因检测最前沿

  从2001年至今,十七年的时间,王凯见证了基因检测技术从一代到二代的技术跨越,也见证了基因检测技术从实验室走向商用的全历程。

  2001年,从白求恩医科大学临床专业毕业后,在中国科学院院士、中国科学院生物物理研究所研究员陈润生的引领下,王凯进入基因检测领域,加入了华大基因公司,接触到Sanger一代测序仪和生物信息学。

  华大基因为王凯打开了基因检测世界的大门。在华大基因工作期间,他参与了“人类基因组计划”的收尾工作,还参加了中国水稻和家猪基因组计划,并发表了人生的第一篇学术文章。

  2003年,王凯从华大基因辞职,到当时世界生物信息学最权威的大学——丹麦科技大学生物序列分析中心(CBS)攻读生物信息学研究生。他的导师Sren Brunak教授是生物信息学的早期奠基人之一,曾任著名的Ensemble数据库主席,ISMB主席,以及欧洲生物信息学中心主席等。

  在CBS读书期间,他参与了DNA元件百科全书计划(Encyclopedia of DNA Elements,简称:ENCODE计划)。ENCODE计划是美国国家人类基因组研究所在2003年9月发起的项目,它也是继“人类基因组计划”后,全球最重要的基因检测项目,它在人类基因测序基础上,对序列的基因结构和功能识别进行研究。

  到2007年,基因二代测序(Next Generation Sequencing,以下简称:NGS)技术逐渐成熟,王凯有机会接触到最先进的基因测序技术。2008年,王凯获得资助进入美国加州洛杉矶分校(UCLA)生物信息学系主任克里斯托弗·李(Christopher Lee)教授的实验室专注做癌症NGS项目,完成博士课题。

  2010年,博士毕业后,王凯进入哈佛大学和Dana Farber癌症研究所,开始博士后学习阶段。他加入了生物信息学的传奇人物DCHIP的牛人李程教授的实验室,继续从事癌症和NGS的相关临床研究。

  李程教授一直致力于研究高通量基因组学数据处理算法、软件开发和在癌症基因组学研究中的应用。其所在实验室开发的dChip、ComBat系列数据分析算法和软件被广泛应用于基因表达和SNP生物芯片的数据分析和可视化,文章被引用3000余次。2013年,李程教授全职加入北京大学生命科学学院后,建立了干湿结合的癌症基因组学实验室,为中国培养融合生物、信息、数学、工程等交叉学科背景的人才。

  2011年秋天,王凯在结束了哈佛大学的博士后研究工作后,加入到FMI,在生信组负责优化基因拷贝数分析流程和建设数据可视化。